Molekul adalah kumpulan neutral elektrik dua atau lebih atom dipegang bersama oleh ikatan kimia. Molekul dibezakan daripada ion oleh kekurangan cas elektrik mereka. Walau bagaimanapun, dalam fizik kuantum, kimia organik, dan biokimia, istilah
molekul sering digunakan dengan kurang ketat, juga digunakan untuk ion poliatomik.
Dalam teori kinetik gas,
molekul istilah sering digunakan untuk sebarang zarah gas tanpa mengira komposisinya. Menurut definisi ini, atom gas mulia dianggap sebagai molekul kerana ia adalah molekul monatomik.
Molekul mungkin homonuklear, iaitu, ia terdiri daripada atom-atom dari satu unsur kimia, seperti oksigen (O2); atau ia mungkin heteronuklear, sebatian kimia yang terdiri daripada lebih daripada satu unsur, seperti air (H2O). Atom dan kompleks yang dihubungkan dengan interaksi bukan kovalen, seperti ikatan hidrogen atau ikatan ionik, umumnya tidak dianggap sebagai molekul tunggal.
Molekul sebagai komponen bahan adalah biasa dalam bahan
organik (dan oleh itu biokimia). Mereka juga membentuk sebahagian besar lautan dan atmosfera. Bagaimanapun, kebanyakan bahan
pepejal yang biasa di Bumi, termasuk kebanyakan mineral yang membentuk kerak, mantel, dan inti Bumi, mengandungi banyak ikatan kimia, tetapi
tidak terbentuk daripada molekul yang dapat dikenal pasti. Selain itu, tiada molekul tipikal boleh ditakrifkan untuk
kristal ionik (garam) dan kristal kovalen (pepejal rangkaian), walaupun ini selalunya terdiri daripada mengulangi sel-sel unit yang memanjangkan sama ada dalam satah (seperti dalam graphene) atau tiga dimensi (seperti dalam berlian, kuarza, atau natrium klorida). Tema berulang-struktur selular-selular juga memegang untuk kebanyakan fasa terkondensasi dengan ikatan logam, yang bermaksud bahawa logam pepejal juga tidak diperbuat daripada molekul. Dalam cermin (pepejal yang wujud dalam keadaan tidak berurutan vitreous), atom juga boleh dipegang bersama oleh ikatan kimia tanpa kehadiran sebarang molekul boleh ditakrifkan, atau mana-mana ketetapan unit berulang yang menyifatkan kristal.